1、网站设计方面
模板站大部分设计相同，一般只是文字内容和图片替换一下，总体设计水平不高，制作出来的网页一般比较粗糙。而定制网站的设计从图片选择到文字字体到网站整体风格设计等都是按照客户的要求定制化流程去做，网站设计美工精良，不会出现雷同设计的网站。
2、程序功能方面
模板网站提供客户许多功能模块供选择，但是这些功能模块的功能都是已经事先定义好的，一般不能定制修改。而定制网站将每一个程序功能都是根据客户的具体要求和差异化要求开发的，后期方面修改。
3、兼容性和搜索引擎友好性
模板网站绝大部分模板网站采用table+css制作网页页面。许多页面代码不符合国际w3c标准，不能与多种浏览器兼容。由于网站模板html代码的雷同，对搜索引擎收录不很友好。而定制网站采用div+css制作网页页面，符合国际w3c标准，网站上线之前经过严格内部测试，与多种浏览器兼容，并对搜索引擎收录更友好，有利于网站在搜索引擎中的排名。
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